证书被撤销后重新申请的流程一般如下：

查找撤销原因：证书被撤销后，企业应第一时间查找原因，明确是因为未达到标准要求，还是违反了相关规定等，如发现有误可进行申诉2.

制定整改计划：针对撤销原因，制定详细的整改计划，明确责任人、具体任务、改进措施和保障措施，并确定时间表，确保整改计划能够真正解决问题2.

执行整改计划：按照整改计划的时间表，严格执行各项整改措施，对已执行的整改进行跟踪检查，防止出现新问题2.

完善质量管理体系：在整改过程中，企业要依据 ISO 9001 标准的最新要求，对现有的质量管理体系进行全面评估和调整完善，包括修改文档、更新程序、改进内部流程等，确保质量管理体系符合标准要求16.

开展内部审核：在完成整改和质量管理体系的调整完善后，企业需组织经过培训的内部审核员进行内部审核，检查质量管理体系的运行情况，确保其符合 ISO 9001 标准要求16.

记录与报告：对内部审核的过程和结果进行记录，形成内部审核报告，为后续的外部审核提供依据16.

选择认证机构：企业可根据自身情况，选择原认证机构或其他有资质的认证机构。若选择原机构，流程可能相对便捷；若选择新机构，则需了解其具体要求和流程36.

提交申请材料：向选定的认证机构提交重新认证的申请，并按要求提供相关材料，如申请书、合同、企业营业执照、组织机构代码证、企业资质许可、企业简介、组织机构图、产品工艺流程图、质量手册和程序文件、内审资料、管理评审资料以及程序文件要求的其它相关表单、第三层次的作业指导书及操作过程的记录等136.

文件审查：认证机构受理申请后，会对企业提交的文件资料进行审查，确认其完整性、准确性和一致性，是否符合 ISO 9001 标准要求6.

现场审核：文件审查通过后，认证机构会安排审核组到企业进行现场审核，通过检查、询问、观察等方式，对企业的质量管理体系的实际运行情况进行全面评估，包括各个部门的运作、生产现场的管理、设备的维护、人员的培训等方面16.

不符合项整改：如果审核中发现不符合项，企业要认真分析原因，制定切实可行的纠正措施，并在规定时间内完成整改，将整改结果书面提交给审核组验证36.

审核组对企业的整改情况进行验证确认符合要求后，认证机构会批准重新认证申请，颁发新的 ISO 9001 认证证书